Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VapbQ9QY76 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms