Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Csnk1eQ9JMK2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnk1eQ9JMK2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms