Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Tgm1Q9JLF6 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tgm1Q9JLF6 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tgm1Q9JLF6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tgm1Q9JLF6 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tgm1Q9JLF6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tgm1Q9JLF6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tgm1Q9JLF6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tgm1Q9JLF6 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms