Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CubnQ9JLB4 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms