Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Hmgn5Q9JL35 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hmgn5Q9JL35 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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