Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Gpa33Q9JKA5 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gpa33Q9JKA5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms