Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
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Rb1cc1Q9ESK9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
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Rb1cc1Q9ESK9 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rb1cc1Q9ESK9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rb1cc1Q9ESK9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rb1cc1Q9ESK9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rb1cc1Q9ESK9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
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Rb1cc1Q9ESK9 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rb1cc1Q9ESK9 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
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Rb1cc1Q9ESK9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rb1cc1Q9ESK9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rb1cc1Q9ESK9 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rb1cc1Q9ESK9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rb1cc1Q9ESK9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rb1cc1Q9ESK9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rb1cc1Q9ESK9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rb1cc1Q9ESK9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rb1cc1Q9ESK9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rb1cc1Q9ESK9 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rb1cc1Q9ESK9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rb1cc1Q9ESK9 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rb1cc1Q9ESK9 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rb1cc1Q9ESK9 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rb1cc1Q9ESK9 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rb1cc1Q9ESK9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rb1cc1Q9ESK9 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rb1cc1Q9ESK9 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rb1cc1Q9ESK9 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rb1cc1Q9ESK9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rb1cc1Q9ESK9 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rb1cc1Q9ESK9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
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