Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp29Q9ES63 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp29Q9ES63 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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