Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clstn1Q9EPL2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms