Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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