Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Olfr472-202ENSMUST00000210420 1083 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Cox7a1-202ENSMUST00000208441 485 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Riok3Q9DBU3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms