Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrpraQ9DBG7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrpraQ9DBG7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms