Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ftsj3Q9DBE9 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms