Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Usp12Q9D9M2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Usp12Q9D9M2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp12Q9D9M2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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