Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Tnfrsf13cQ9D8D0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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