Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Capns2Q9D7J7 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Capns2Q9D7J7 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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