Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc130Q9D516 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc130Q9D516 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms