Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms