Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syf2Q9D198 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms