Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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Zbed3Q9D0L1 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbed3Q9D0L1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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