Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Shmt2Q9CZN7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shmt2Q9CZN7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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