Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nip7Q9CXK8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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