Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnot11Q9CWN7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnot11Q9CWN7 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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