Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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