Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snw1Q9CSN1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms