Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms