Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Higd2aQ9CQJ1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms