Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms