Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc5Q9CQA1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms