Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg3Q9CPX6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms