Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms