Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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