Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp16Q99LG0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms