Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms