Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms