Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms