Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trim7Q923T7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trim7Q923T7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trim7Q923T7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trim7Q923T7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trim7Q923T7 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trim7Q923T7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trim7Q923T7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Trim7Q923T7 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Trim7Q923T7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Trim7Q923T7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim7Q923T7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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