Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim59Q922Y2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms