Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Med28Q920D3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med28Q920D3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms