Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc8Q8VD72 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms