Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1Q8VCQ6 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Sgms1Q8VCQ6 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Sgms1Q8VCQ6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Sgms1Q8VCQ6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Sgms1Q8VCQ6 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Sgms1Q8VCQ6 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Sgms1Q8VCQ6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Sgms1Q8VCQ6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Sgms1Q8VCQ6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Sgms1Q8VCQ6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Sgms1Q8VCQ6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Sgms1Q8VCQ6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Sgms1Q8VCQ6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Sgms1Q8VCQ6 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Sgms1Q8VCQ6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Sgms1Q8VCQ6 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Sgms1Q8VCQ6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Sgms1Q8VCQ6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Sgms1Q8VCQ6 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sgms1Q8VCQ6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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