Protein–RNA interactions for Protein: Q8R5K2

Usp33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp33Q8R5K2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp33Q8R5K2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms