Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hecw1Q8K4P8 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms