Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms