Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Trappc12Q8K2L8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms