Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Scara5Q8K299 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Scara5Q8K299 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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Scara5Q8K299 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Scara5Q8K299 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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