Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms