Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkn3Q8K045 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms