Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms