Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ufl1Q8CCJ3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufl1Q8CCJ3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms